６部作の中間を後から作るという問題

本作の問題として、前日譚である「プロメテウス」も後日譚である「エイリアン」も既に存在していて、後から間を埋めようとしていることがあります。ですから、物語としての整合性を取るのがすごく難しくなっています。
中心的な謎は、「エイリアンは、どのようにして誕生したか？」です。